RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	EBI3	Q14213	229 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SPESP1	Q6UW49	350 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PQLC3	Q8N755	202 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM230	Q96A57	120 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT14	Q96FL9	552 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PDXP	Q96GD0	296 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CLN8	Q9UBY8	286 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RDH16	O75452	317 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CTAG2	O75638	210 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RP2	O75695	350 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FLOT1	O75955	427 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CTDNEP1	O95476	244 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SFTPC	P11686	197 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP10-1	P60331	282 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CDH17	Q12864	832 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IFT88	Q13099	833 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RCAN2	Q14206	197 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	COMMD1	Q8N668	190 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	METTL13	Q8N6R0	699 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	LRRC29	Q8WV35	223 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	APH1B	Q8WW43	257 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UCK2	Q9BZX2	261 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NTN4	Q9HB63	628 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		2.54	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR6C74	A6NCV1	312 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		K7EMT4	169 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876		L7N2F9	121 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	AQP8	O94778	261 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CD160	O95971	181 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ASGR1	P07306	291 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CD3G	P09693	182 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	RAB3A	P20336	220 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	P2RX1	P51575	399 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PPP1CB	P62140	327 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ESRRG	P62508	458 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ITIH4	Q14624	930 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	IRF4	Q15306	451 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MICU2	Q8IYU8	434 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	CHST4	Q8NCG5	386 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	AGR3	Q8TD06	166 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	COL21A1	Q96P44	957 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	C12orf10	Q9HB07	376 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	HMG20A	Q9NP66	347 aa		2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RBM23-208	ENST00000553876	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RBM23-208	ENST00000553876	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RBM23-208	ENST00000553876	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RBM23-208	ENST00000553876	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RBM23-208	ENST00000553876		M0R3G1	203 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RBM23-208	ENST00000553876	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01

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