RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RAB1AP62820 205 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ACSM1Q08AH1 577 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CDONQ4KMG0 1287 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ST7LQ8TDW4 575 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 COG8Q96MW5 612 aa8.15□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ATF6BQ99941 703 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ABHD6Q9BV23 337 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EMC7Q9NPA0 242 aa8.15□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CACNA1CQ13936 2221 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 A0A096LPE4 126 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPZ6 126 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C3orf80F5H4A9 247 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 DOK2O60496 412 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CLPTM1O96005 669 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SERPINA5P05154 406 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LIMS3P0CW19 117 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LIMS4P0CW20 117 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CD79AP11912 226 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF32P17041 273 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HSD11B1P28845 292 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TTKP33981 857 aa8.14□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 NR1H2P55055 460 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TPTEP56180 551 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 GPR50Q13585 617 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 IRF3Q14653 427 aa8.14□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 SPHARQ15513 63 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MEP1BQ16820 701 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 DRAM2Q6UX65 266 aa8.14□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SYNGR3O43761 229 aa8.13□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 GPANK1O95872 356 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 IGKV3-15P01624 115 aa8.13□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 MT-ND2P03891 347 aa8.13□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 MMP16P51512 607 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CCR9P51686 369 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PSG4Q00888 419 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF85Q03923 595 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FAM27E3Q08E93 113 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.13□□□□□ -1.11
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