RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 B4GALT1P15291 398 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 CDC20Q12834 499 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TPRA1Q86W33 373 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 FAM117AQ9C073 453 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 LUZP4Q9P127 313 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.45□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 A0A0G2JK05 382 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 NOTOA8MTQ0 251 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 ZNF432O94892 652 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ETV6P41212 452 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 PPP3R1P63098 170 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 HIST3H3Q16695 136 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TEX30Q5JUR7 227 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 TMEM123Q8N131 208 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GAL3ST1Q99999 423 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SLITRK2Q9H156 845 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 DHDHQ9UQ10 334 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 NBASA2RRP1 2371 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ACOT7O00154 380 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 MSR1P21757 451 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 THBS2P35442 1172 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 TALDO1P37837 337 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GNALP38405 381 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 MEIOBQ8N635 442 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.44□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 V9GY05 133 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JMP0 313 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 A0A0X1KG70 313 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GPR171O14626 319 aa7.43□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 SYNGR4O95473 234 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 ZNF24P17028 368 aa7.43□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 EVX1P49640 407 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PRSS12P56730 875 aa7.43□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 Q8N402 240 aa7.43□□□□□ -1.22
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CS-215ENST00000549143 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 GFI1Q99684 422 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SOX7Q9BT81 388 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 MFRPQ9BY79 579 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 SRRQ9GZT4 340 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 NELFAQ9H3P2 528 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-215ENST00000549143 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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