RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF69Q9UC07 566 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.14□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IFNL4K9M1U5 179 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TSPAN15O95858 294 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IGHV2-70P01814 119 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 THRBP10828 461 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IFI30P13284 250 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF12P17014 697 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MSR1P21757 451 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CPT2P23786 658 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CTXN1P60606 82 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 BTG1P62324 171 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ST3GAL3Q11203 375 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PSG7Q13046 419 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CDK5R2Q13319 367 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RIPK1Q13546 671 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SELPLGQ14242 412 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CCDC80Q76M96 950 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SYT9Q86SS6 491 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LIPHQ8WWY8 451 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 NABP1Q96AH0 204 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 NPHS2Q9NP85 383 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 MMP26Q9NRE1 261 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.13□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LRRC30A6NM36 301 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 G3V4G9 280 aa7.12□□□□□ -1.27
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TROAP-208ENST00000548817 XKRYO14609 159 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CRYBA1P05813 215 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 COX5BP10606 129 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SELEP16581 610 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 OMGP23515 440 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 HTR5AP47898 357 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SLC6A9P48067 706 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 FAM189A2Q15884 450 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RRM2BQ7LG56 351 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LZICQ8WZA0 190 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 PTP4A1Q93096 173 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CMBLQ96DG6 245 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IL19Q9UHD0 177 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.12□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 SGCEO43556 437 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 DOK2O60496 412 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 ICMTO60725 284 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 CLPXO76031 633 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 GPANK1O95872 356 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 IRF2P14316 349 aa7.11□□□□□ -1.27
TROAP-208ENST00000548817 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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