RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540251.5

NEK2-205, Transcript of NIMA related kinase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK2, Length 1,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2-205ENST00000540251 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 A6NNC1 897 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 COX6B1P14854 86 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 ZNF83P51522 516 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 NUDT6P53370 316 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 NAAAQ02083 359 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 ROM1Q03395 351 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 OTPQ5XKR4 325 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 CORO6Q6QEF8 472 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 ABHD6Q9BV23 337 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 Q9H521 79 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK2-205ENST00000540251 PHYHO14832 338 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CELA3BP08861 270 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 SPARCP09486 303 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 PCSK6P29122 969 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 KLHL22Q53GT1 634 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF774Q6NX45 483 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 LGALS12Q96DT0 336 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 RNFT2Q96EX2 444 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 IRGMA1A4Y4 181 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 M0R1B8 84 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 DOK2O60496 412 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 IGHA1P01876 353 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 LYNP07948 512 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CCDC159P0C7I6 412 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 STOMP27105 288 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 DCTDP32321 178 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 BSPH1Q075Z2 132 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 SLAMF6Q96DU3 332 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ATF6BQ99941 703 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF878C9JN71 531 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 J3QW42 95 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CRYAAP02489 173 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 OPRL1P41146 370 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ACTC1P68032 377 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ACTA1P68133 377 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 EGR3Q06889 387 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 AMELYQ99218 206 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF649Q9BS31 505 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 NIPAL2Q9H841 368 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 COPS3Q9UNS2 423 aa15.94■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ZNF254O75437 659 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CTAG2O75638 210 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CD3EP07766 207 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 DCKP27707 260 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CALCRP30988 508 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 APLNRP35414 380 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 NUP37Q8NFH4 326 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 AMBNQ9NP70 447 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK2-205ENST00000540251 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms