RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 RAC3P60763 192 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RAB11AP62491 216 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CDK3Q00526 305 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 IRF8Q02556 426 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SCGB2A2Q13296 93 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 NFATC2Q13469 925 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SHBQ15464 509 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TAF13Q15543 124 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB6Q15916 424 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TCTN1Q2MV58 587 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PHF19Q5T6S3 580 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TEX38Q6PEX7 206 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM205Q6UW68 189 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 Q6ZRG5 221 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 GKN2Q86XP6 184 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SYT12Q8IV01 421 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 DEFB106AQ8N104 65 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TEX26Q8N6G2 289 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RNF149Q8NC42 400 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 NAXEQ8NCW5 288 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM234Q8WY98 164 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 FRZBQ92765 325 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 DDIT4LQ96D03 193 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SMIM19Q96E16 107 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PRRC1Q96M27 445 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 OR8B4Q96RC9 309 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ORAI2Q96SN7 254 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RAB33BQ9H082 229 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RERGLQ9H628 205 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SGK2Q9HBY8 427 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 GPR35Q9HC97 309 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RAB18Q9NP72 206 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 YIPF1Q9Y548 306 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 COX11Q9Y6N1 276 aa5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CTSVO60911 334 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 NDUFS3O75489 264 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 GPANK1O95872 356 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ONECUT2O95948 504 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TGFB1P01137 390 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TRGC2P03986 189 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ARG1P05089 322 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ELFN1P0C7U0 828 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ALPPL2P10696 532 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ACP5P13686 325 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RAB6AP20340 208 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 SERPINA2P20848 420 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 IMPA1P29218 277 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 APLNRP35414 380 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CEACAM3P40198 252 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 TNFSF9P41273 254 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ATP1B3P54709 279 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 ERVFRD-1P60508 538 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CSNK1G2P78368 415 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PTSQ03393 145 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CHIT1Q13231 466 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 CAPSQ13938 189 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 PDE7AQ13946 482 aa5.54□□□□□ -1.52
SNHG1-211ENST00000539921 GPNMBQ14956 572 aa5.54□□□□□ -1.52
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