RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FREM3	P0C091	2139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RAF1	P04049	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RAB3B	P20337	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF45	Q02386	682 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1B0GVC2	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	AQP7	O14520	342 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	MMP16	P51512	607 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CXADR	P78310	365 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	C3AR1	Q16581	482 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610		Q6ZS92	163 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	GPR35	Q9HC97	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	MED12	Q93074	2177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1B0GTH9	108 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1W2PPK0	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	C1QL1	O75973	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	APOC1	P02654	83 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PRB1	P04280	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SRM	P19623	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	STK11	Q15831	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CTDSP2	O14595	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	DVL2	O14641	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PNP	P00491	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CD2	P06729	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CST2	P09228	141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	BMP4	P12644	408 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NTF4	P34130	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	UCN	P55089	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CAV3	P56539	151 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PCBD1	P61457	104 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	2e-10	■□□□□ 8.5
ATG13-222	ENST00000534610	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FOXB1	Q99853	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610		K7ENP7	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	RER1	O15258	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATG13-222	ENST00000534610	NCR1	O76036	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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