RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 CBFBQ13951 182 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF141Q15928 474 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 THAP4Q8WY91 577 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CMKLR1Q99788 373 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SYT4Q9H2B2 425 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 LANCL2Q9NS86 450 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MOKQ9UQ07 419 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CMAHPQ9Y471 501 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GVC2 190 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PQM1 296 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 FRG2CA6NGY1 282 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 A6NIN4 97 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 G3V3Y1 287 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GABRPO00591 440 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZFAND5O76080 213 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SPARCP09486 303 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GABRA5P31644 462 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CD96P40200 585 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MAP2K3P46734 347 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN20P56880 219 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SKP2Q13309 424 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 DNLZQ5SXM8 178 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD2Q86X83 199 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 NEK7Q8TDX7 302 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A7Q92504 469 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 HGDQ93099 445 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 SLITRK2Q9H156 845 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 CENPMQ9NSP4 180 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM72A0PK05 275 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf65A6NEN9 183 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 DISC1C4P0D8 188 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 SUSD5O60279 629 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 GDF9O60383 454 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 TIAF1O95411 115 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CD14P08571 375 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 S100A11P31949 105 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CCR6P51684 374 aa7.09□□□□□ -1.28
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF117Q03924 483 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 OR7A5Q15622 319 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 APOOLQ6UXV4 268 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.09□□□□□ -1.28
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TRPS1-208ENST00000519076 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF222Q9UK12 451 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.09□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF823P16415 610 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R43P59537 309 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-208ENST00000519076 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.08□□□□□ -1.28
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