RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRC42Q9Y546 428 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MPDZO75970 2070 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1W2PNV4 684 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRSS37A4D1T9 235 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 A6NIZ1 184 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HSPB2A8KAH6 182 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 H7C1C5 153 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 M0R129 80 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 M0R3G1 203 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 XKRYO14609 159 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SURF4O15260 269 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC16A7O60669 478 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UPK3AO75631 287 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRT33AO76009 404 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF432O94892 652 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PNPP00491 289 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CGAP01215 116 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRHP06850 196 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 STSP08842 583 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GNAO1P09471 354 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UQCRFS1P47985 274 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CENPAP49450 140 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDC42P60953 191 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAP1BP61224 184 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ISL1P61371 349 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LCN6P62502 163 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAP1AP62834 184 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HSPB2Q16082 182 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ETFDHQ16134 617 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGGHGQ32M88 737 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR31Q5SQ13 230 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 THEM4Q5T1C6 240 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CST9LP1Q5W188 147 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 C12orf73Q69YU5 71 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2A2Q6IF42 318 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LEG1Q6P5S2 330 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 VWA1Q6PCB0 445 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM122BQ7Z309 247 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FJX1Q86VR8 437 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6V1Q8N148 313 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASB10Q8WXI3 467 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NSMAFQ92636 917 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RND1Q92730 232 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM54Q969K7 222 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCHR2Q969V1 340 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RDH12Q96NR8 316 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2M2Q96R28 347 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUAK2Q9H093 628 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MED20Q9H944 212 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 AMBNQ9NP70 447 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLTPQ9NZD2 209 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 EMC3Q9P0I2 261 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 B9D1Q9UPM9 204 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF6Q9Y252 685 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MEMO1Q9Y316 297 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 DOCK7Q96N67 2140 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RTTNQ86VV8 2226 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1B0GUH1 482 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE2QL1A1L167 161 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM183AA6NL82 134 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIIAD1A6NNX1 92 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms