RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.42□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.42□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa-0.42□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRB1P82279 1406 aa-0.42□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.42□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAV2Q8IVL1 2488 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GUH1 482 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GGTLC3B5MD39 225 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOM1O60784 492 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR7A10O76100 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf105O95561 183 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAPSAO96009 420 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAHP00439 452 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGFAP01135 160 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD37P11049 281 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNB1P14635 433 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF708P17019 499 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB3BP20337 219 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5DP30049 168 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR3P79522 188 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARF5P84085 180 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCF23Q7RTU1 214 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEX26Q7Z412 305 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GID4Q8IVV7 300 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EID2Q8N6I1 236 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf72Q8NBR9 251 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC26A10Q8NG04 563 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7orf34Q96L11 122 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRORYQ9H606 182 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VSIRQ9H7M9 311 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VANGL2Q9ULK5 521 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.43□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLRN2A0PK11 232 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL21O00585 134 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM44O43615 452 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPM1O60762 260 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINB7O75635 380 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT-ATP6P00846 226 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CALM1P0DP23 149 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CALM2P0DP24 149 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CALM3P0DP25 149 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NELFEP18615 380 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLA-DMAP28067 261 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAP3P28838 519 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNA11P29992 359 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMP2P54851 167 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYNJ2BPP57105 145 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DOC2AQ14183 400 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCEAL5Q5H9L2 206 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3F3CQ6NXT2 135 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2G2Q8NGZ5 317 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCEAL3Q969E4 200 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C12orf42Q96LP6 360 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM206AQ9NX38 181 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAS2R5Q9NYW4 299 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTNNA3Q9UI47 895 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL7A1Q02388 2944 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa-0.44□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSH2Q76I76 1423 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYSFO75923 2080 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6C74A6NCV1 312 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 G3V3Q6 166 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BQ85 93 aa-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms