RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516414.1

RNU6-1049P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1049, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1049P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CLEC4AQ9UMR7 237 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PLCH2O75038 1416 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLIT2O94813 1529 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 E9PCH4 1651 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PTPRBP23467 1997 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 POLEQ07864 2286 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 UBN2Q6ZU65 1347 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 A0A1W2PRQ8 180 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF860A6NHJ4 632 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C12orf71A8MTZ7 269 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 A8MUN3 132 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NPIPA7E9PJI5 369 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HIP1O00291 1037 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCL21O00585 134 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 XKRYO14609 159 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RASGRF2O14827 1237 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ARPC3O15145 178 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 BUB1O43683 1085 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SNNO75324 88 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 YIF1AO95070 293 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MFN2O95140 757 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 VAMP5O95183 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CD160O95971 181 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IL1BP01584 269 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CSF2P04141 144 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RPN2P04844 631 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 LGALS2P05162 132 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SERPIND1P05546 499 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGKV5-2P06315 115 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 APRTP07741 180 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RHOCP08134 193 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CISD3P0C7P0 127 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 POLR2MP0CAP2 368 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PGA4P0DJD7 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PGA3P0DJD8 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NPIPA8P0DM63 369 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PPIAL4GP0DN37 164 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MCF2P10911 925 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CTLA4P16410 223 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RAB3BP20337 219 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 COX5AP20674 150 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OMGP23515 440 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IL32P24001 234 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DNAJB1P25685 340 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 AK4P27144 223 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RORAP35398 523 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 APLNRP35414 380 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TFPI2P48307 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TGM4P49221 684 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PRLHRP49683 370 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ACOT2P49753 483 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TAS2R46P59540 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GPX6P59796 221 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 BPIFB3P59826 476 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CRADDP78560 199 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CDKL1Q00532 357 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HSF2Q03933 536 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SIGLEC14Q08ET2 396 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ECH1Q13011 328 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ERCC8Q13216 396 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SELENBP1Q13228 472 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SNX1Q13596 522 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GINS1Q14691 196 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF141Q15928 474 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MICBQ29980 383 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 KLHL40Q2TBA0 621 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MAJINQ3KP22 176 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DDI2Q5TDH0 399 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 FAM222AQ5U5X8 452 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MED27Q6P2C8 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TEX43Q6ZNM6 134 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC80Q76M96 950 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CBLN2Q8IUK8 224 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms