RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	FEV	Q99581	238 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SERF1B-208	ENST00000515588	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CD5L	O43866	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	FKBP6	O75344	327 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	DBH	P09172	617 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GSTM3	P21266	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GIF	P27352	417 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PYCR1	P32322	319 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	MAGEB1	P43366	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	TEK	Q02763	1124 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GLO1	Q04760	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	RIN1	Q13671	783 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GK3P	Q14409	553 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ABHD16A	O95870	558 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	COL8A2	P25067	703 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GGT2	P36268	569 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	COX10	Q12887	443 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GNGT2	O14610	69 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PRKACG	P22612	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GCH1	P30793	250 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	MMP15	P51511	669 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CBX1	P83916	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CRMP1	Q14194	572 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588		H3BSA7	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	LILRA1	O75019	489 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ATP5H	O75947	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	GYPB	P06028	91 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PSKH1	P11801	424 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	CCL8	P80075	99 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PSG7	Q13046	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	TRIP10	Q15642	601 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ARL9	Q6T311	187 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	RDH5	Q92781	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	COQ7	Q99807	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF1B-208	ENST00000515588	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms