RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFSF9P41273 254 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NTRK2Q16620 822 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB134Q4QY38 66 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM122BQ7Z309 247 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CALHM1Q8IU99 346 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KPTNQ9Y664 436 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR8U8P0C7N1 319 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC10A1Q14973 349 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZNX1 250 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAQR8Q8TEZ7 354 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF5P12034 268 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GZMHP20718 246 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRSS3P35030 304 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LSM6P62312 80 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GSG1Q2KHT4 349 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM150BA6NC51 233 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BANF1O75531 89 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PGA3P0DJD8 388 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NTF3P20783 257 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MMP11P24347 488 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCTPQ9UKL6 214 aa4.13□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCTN6O00399 190 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf105O95561 183 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD96P40200 585 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAS2R39P59534 338 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TP53I3Q53FA7 332 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLMPQ9H6B4 373 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TREX1Q9NSU2 369 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A6NJY4 79 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFS8O00217 210 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 F2RL2O00254 374 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF611Q8N823 705 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANTXRLA6NF34 631 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WNT9BO14905 357 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNRHRP30968 328 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASIPP42127 132 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEX101Q9BY14 249 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CXorf21Q9HAI6 301 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR2A25A4D2G3 310 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLATP00750 562 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AREGP15514 252 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAC3P60763 192 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCLAFQ15004 111 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSLPQ969D9 159 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LMF1Q96S06 567 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAPN10Q9HC96 672 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LANCL1O43813 399 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PELI1Q96FA3 418 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OXGR1Q96P68 337 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 F2RL3Q96RI0 385 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SHBQ15464 509 aa4.12□□□□□ -1.75
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms