RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498237.3

BPNT1-208, Transcript of 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1, human

TSL 3

Gene BPNT1, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BPNT1-208	ENST00000498237	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	EBAG9	O00559	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	KRT36	O76013	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	TPPP	O94811	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	VENTX	O95231	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CH25H	O95992	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FABP3	P05413	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MAK	P20794	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	POU1F1	P28069	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	UGT2B10	P36537	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	OMP	P47874	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CAMLG	P49069	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF134	P52741	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FHL3	Q13643	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GK3P	Q14409	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	STK11	Q15831	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237		Q6ZT83	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	LRR1	Q96L50	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GPA33	Q99795	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NANS	Q9NR45	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SLC25A17	O43808	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PSPN	O60542	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	LMX1B	O60663	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	DIRAS1	O95057	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GADD45G	O95257	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ADA	P00813	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FREM3	P0C091	2139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	IFI30	P13284	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PPP3CB	P16298	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF43	P17038	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	COX5A	P20674	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	MTNR1A	P48039	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GSS	P48637	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SLC9A3	P48764	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	SIRPA	P78324	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	PUDP	Q08623	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	FLOT2	Q14254	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BPNT1-208	ENST00000498237	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms