RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.1□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.1□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ITPR2Q14571 2701 aa3.1□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PDZD2O15018 2839 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IDSB3KWA1 339 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLC37A4O43826 429 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GZMAP12544 262 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 POU2F1P14859 743 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ETS2P15036 469 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 COX5AP20674 150 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CALCRP30988 508 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HOXA6P31267 233 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PSMD7P51665 324 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJC3Q13217 504 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 ARFRP1Q13795 201 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CEP55Q53EZ4 464 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC6Q86X45 466 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BBOF1Q8ND07 529 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DTX3LQ8TDB6 740 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DDI1Q8WTU0 396 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DCUN1D4Q92564 292 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 UBE2E3Q969T4 207 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SNF8Q96H20 258 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 COQ2Q96H96 371 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 BIRC8Q96P09 236 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RNF2Q99496 336 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 NAT9Q9BTE0 207 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 TRABDQ9H4I3 376 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 REEP4Q9H6H4 257 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 DMAC2Q9NW81 257 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 RAB23Q9ULC3 237 aa3.09□□□□□ -1.91
POLR1B-215ENST00000498054 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.09□□□□□ -1.91
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POLR1B-215ENST00000498054 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.09□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 COL1A2P08123 1366 aa3.09□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 THADAQ6YHU6 1953 aa3.09□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LRRK2Q5S007 2527 aa3.09□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CACNA1EQ15878 2313 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0G2JRQ6 117 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0J9YXY3 114 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SMCO2A6NFE2 343 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 M0QZ92 97 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 DCTN6O00399 190 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GYG2O15488 501 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CALUO43852 315 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PFDN1O60925 122 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SPAG7O75391 227 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 MMP23AO75900 390 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SNAPINO95295 136 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ACTL6AO96019 429 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 P04436 131 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF19P17023 458 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CCR1P32246 355 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SHMT2P34897 504 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K8P41279 467 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 HLCSP50747 726 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GPM6AP51674 278 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ATP1B3P54709 279 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LYZP61626 148 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SELENOTP62341 195 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF17Q02223 184 aa3.08□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RELAQ04206 551 aa3.08□□□□□ -1.92
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