RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A087WUU8	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MRAS	O14807	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ANGPT2	O15123	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF13	O43567	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FCN3	O75636	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GPANK1	O95872	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IFNA2	P01563	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHG1	P01857	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SEMG1	P04279	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MSMB	P08118	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ADH4	P08319	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CTLA4	P16410	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ADRA2C	P18825	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GYS2	P54840	703 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ERVK-25	P63136	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CCL8	P80075	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PAX2	Q02962	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SEC23B	Q15437	767 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RDH5	Q92781	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PPW3	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DCTN6	O00399	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MLNR	O43193	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PLPP2	O43688	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	BCL10	O95999	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TF	P02787	698 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CD55	P08174	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	UMPS	P11172	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IFI30	P13284	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LAP3	P28838	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LSP1	P33241	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KDELR2	P33947	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CRYBB2	P43320	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR4	P46093	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GSK3B	P49841	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	UCP2	P55851	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CLRN1	P58418	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TAS2R41	P59536	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PRKCD	Q05655	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms