RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491701.1

CLIP4-211, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene CLIP4, Length 1,401 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-211ENST00000491701 MED12LQ86YW9 2145 aa3.96□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PTPN13Q12923 2485 aa3.96□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CACNA1CQ13936 2221 aa3.96□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 A0A0B4J2E0 115 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 A0A1B0GWA3 101 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 A0A1B0GX12 115 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 A0A1W2PPK0 400 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 A0A1W2PQD3 144 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GAGE12BA1L429 117 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 LRRN3E7EW58 273 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 K7EM74 188 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 WRBO00258 174 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TNFRSF11BO00300 401 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 IMPA2O14732 288 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 NME2P1O60361 137 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZFAND5O76080 213 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 FABP3P05413 133 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 RRASP10301 218 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 LIFP15018 202 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 KLK2P20151 261 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SHC1P29353 583 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 BMI1P35226 326 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 NUDT6P53370 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CDH12P55289 794 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CDK5Q00535 292 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZNF117Q03924 483 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PRKCDQ05655 676 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CD47Q08722 323 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DECR1Q16698 335 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ERASQ7Z444 233 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 BIVMQ86UB2 503 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 LNX2Q8N448 690 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 COX18Q8N8Q8 333 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GIPC3Q8TF64 312 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 HAS2Q92819 552 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GGHQ92820 318 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SLC38A4Q969I6 547 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SLC35B4Q969S0 331 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 C4orf36Q96KX1 117 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TIMP4Q99727 224 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZNF649Q9BS31 505 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ALG12Q9BV10 488 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 DSN1Q9H410 356 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 EXD2Q9NVH0 621 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PRODH2Q9UF12 536 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TMEM89A2RUT3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 PRSS46E5RG02 174 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 G3V2T6 193 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 H0YIZ8 118 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 H3BNH8 94 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 FAAHO00519 579 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 GMNNO75496 209 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 REM1O75628 298 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 SERPINB7O75635 380 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 CEACAM4O75871 244 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 OR2J2O76002 312 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 NEURL1O76050 574 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 NDUFB4O95168 129 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 OR5F1O95221 314 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 HPP00738 406 aa3.95□□□□□ -1.78
CLIP4-211ENST00000491701 HPRP00739 348 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms