RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ABHD16AO95870 558 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 IGHV3-13P01766 116 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 HLA-DQA2P01906 255 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GCH1P30793 250 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MSMPQ1L6U9 139 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FAM209AQ5JX71 171 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SNX33Q8WV41 574 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SYT3Q9BQG1 590 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 REG4Q9BYZ8 158 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 TFP02787 698 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ADRA2AP08913 450 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FMO3P31513 532 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PPP1CBP62140 327 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CCNIQ14094 377 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CRMP1Q14194 572 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 TEX30Q5JUR7 227 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SLC18B1Q6NT16 456 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FAHD1Q6P587 224 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ABHD4Q8TB40 342 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CYSLTR2Q9NS75 346 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 G3V2T6 193 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 RER1O15258 196 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GGT2P36268 569 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ACTR3P61158 418 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ESRRGP62508 458 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CDK5Q00535 292 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZMAT1Q5H9K5 638 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZNF525Q8N782 197 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 OR5L1Q8NGL2 311 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FN3KQ9H479 309 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MTORP42345 2549 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SPI1P17947 270 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ERFP50548 548 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GINS1Q14691 196 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MEP1BQ16820 701 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PCK2Q16822 640 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 LRP11Q86VZ4 500 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ZNF786Q8N393 782 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 OR51B6Q9H340 312 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 C17orf100A8MU93 164 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 RNF223E7ERA6 249 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GPANK1O95872 356 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 HEXAP06865 529 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PRKACGP22612 351 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 POU1F1P28069 291 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PYCR1P32322 319 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ENTPD1P49961 510 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ERVS71-1P61550 626 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 DIRC2Q96SL1 478 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 PITX2Q99697 317 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 ATF6BQ99941 703 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 FZR1Q9UM11 496 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-203ENST00000474160 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms