RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	COX10	Q12887	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RERGL	Q9H628	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HSPG2	P98160	4391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		M0R233	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARPC2	O15144	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CLPX	O76031	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LYPD3	O95274	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC2A10	O95528	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PTH	P01270	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGF2	P01344	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MT-ND5	P03915	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FABP3	P05413	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LCK	P06239	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RHCE	P18577	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCNO	P22674	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NOS3	P29474	1203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	APLNR	P35414	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IFNGR2	P38484	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CENPA	P49450	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PROK1	P58294	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CTXN1	P60606	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RAB1A	P62820	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LCN2	P80188	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MVK	Q03426	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FMOD	Q06828	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RAB39A	Q14964	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SGCA	Q16586	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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