RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	APOC1	P02654	83 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA5	P08648	1049 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	COX5B	P10606	129 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CA7	P43166	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CASP6	P55212	293 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PER3	P56645	1201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FAP	Q12884	760 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6C6	A6NF89	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-DPB1	P04440	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CEL	P19835	753 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRA5	P31644	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ARR3	P36575	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYBB2	P43320	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB35	Q15286	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRA6	Q16445	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CTF1	Q16619	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529		R4GMQ9	66 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529		A8MXE2	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RER1	O15258	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNGR3	O43761	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SC5D	O75845	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ISG15	P05161	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT1	P15291	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PSG4	Q00888	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	PMPCA	Q10713	525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SSX8	Q7RTT4	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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