RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SPHAR	Q15513	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MED22	Q15528	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TGIF1	Q15583	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SGCB	Q16585	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MIDN	Q504T8	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	HTRA1	Q92743	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	HAS2	Q92819	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LRR1	Q96L50	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC66-211	ENST00000468108	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	EFNA2	O43921	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	ZIC3	O60481	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	SNAPC5	O75971	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	NEURL1	O76050	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	OR6A2	O95222	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB36	O95755	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	TXNDC12	O95881	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF24	P17028	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF3	P17036	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	MYL12A	P19105	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	PTN	P21246	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	DPP4	P27487	766 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	GRPR	P30550	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	HTR1F	P30939	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	SRD5A2	P31213	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	TNFSF8	P32971	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	AQP2	P41181	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	MTNR1A	P48039	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	CDH11	P55287	796 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	PPP3R1	P63098	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	FOXF1	Q12946	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC66-211	ENST00000468108	MFAP5	Q13361	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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