RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRGBPQ9NV56 204 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 GID8Q9NWU2 228 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.11□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GWJ7 208 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ISPDA4D126 451 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLNRO43193 412 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SGCEO43556 437 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF682O95780 498 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABHD16AO95870 558 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINA1P01009 418 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEMG1P04279 462 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF12P17014 697 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 GATA3P23771 443 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDHAP31040 664 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC6A9P48067 706 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MMP16P51512 607 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCBD1P61457 104 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP6Q13520 282 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNMB1Q16558 191 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEP1BQ16820 701 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 AWAT1Q58HT5 328 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NANPQ8TBE9 248 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 LZICQ8WZA0 190 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAVCR1Q96D42 359 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMBLQ96DG6 245 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMD4Q96H15 378 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAMD8Q96LT4 415 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSSK2Q96PF2 358 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIRC2Q96SL1 478 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUAK2Q9H093 628 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF69Q9UC07 566 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.1□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 VWFP04275 2813 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YL77 283 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM178BH3BS89 294 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM77I1YAP6 450 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOCS2O14508 198 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 RER1O15258 196 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 AHCYL1O43865 530 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXH1O75593 365 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIRAS1O95057 198 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFB2O95178 105 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNDC12O95881 172 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SBK2P0C263 348 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SELEP16581 610 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMELP40967 661 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS12P56730 875 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTG1P62324 171 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTG1P63261 375 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC3A1Q07837 685 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF154Q13106 437 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AS1Q8N127 324 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2V2Q96R30 315 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms