RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		15.03	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		15.03	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		15.03	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6C6	A6NF89	314 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	SOCS2	O14508	198 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	MPZL1	O95297	269 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS6KA3	P51812	740 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM11A	P58511	58 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTG1	P63261	375 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT72	Q14CN4	511 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRN	Q5BIV9	151 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	OTP	Q5XKR4	325 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	MSL2	Q9HCI7	577 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738		V9GYQ6	96 aa		15.02	■□□□□ -0
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM89	A2RUT3	159 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN6	O00399	190 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPC2	O15144	300 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPC3	O15145	178 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GADD45G	O95257	159 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV2-5	P01817	119 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ANPEP	P15144	967 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KITLG	P21583	273 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK5R2	Q13319	367 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RFX4	Q33E94	735 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A6	Q92536	515 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL17	Q92583	94 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB39B	Q96DA2	213 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CDRT15	Q96T59	188 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52D1	Q9H346	318 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	STARD10	Q9Y365	291 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		15.01	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738		J3QW42	95 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RER1	O15258	196 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNAB3	O43448	404 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R3D	O95685	299 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTM3	P21266	225 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FPR3	P25089	353 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CRABP1	P29762	137 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H3A	P68431	136 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SPIB	Q01892	262 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZR03	302 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FANK1	Q8TC84	345 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB1C	Q92928	201 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMD4	Q96H15	378 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	COG8	Q96MW5	612 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TSSK2	Q96PF2	358 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RERGL	Q9H628	205 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		15	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GPANK1	O95872	356 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PNP	P00491	289 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FABP3	P05413	133 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GSS	P48637	474 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GYS2	P54840	703 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GNGT1	P63211	74 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC3A1	Q07837	685 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATS1	Q496A3	300 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	USP43	Q70EL4	1123 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6V1	Q8N148	313 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HAVCR1	Q96D42	359 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	B9D1	Q9UPM9	204 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		14.99	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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