RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SUCNR1Q9BXA5 334 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SYT4Q9H2B2 425 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 POFUT1Q9H488 388 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PLEK2Q9NYT0 353 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFAF4Q9P032 175 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 IL19Q9UHD0 177 aa17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM77I1YAP6 450 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TXNDC12O95881 172 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 OMPP47874 163 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 KCNMB1Q16558 191 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM155Q4W5P6 130 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SPICQ8N5J4 248 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RASD2Q96D21 266 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 HAVCR1Q96D42 359 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS1Q96LJ7 313 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 ASH2LQ9UBL3 628 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 OPN4Q9UHM6 478 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TENM1Q9UKZ4 2725 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SURF4O15260 269 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A7O60669 478 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 CFPP27918 469 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RGS6P49758 472 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PGM2L1Q6PCE3 622 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZR03 302 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 PTP4A1Q93096 173 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf34Q96L11 122 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 STARD10Q9Y365 291 aa17.71■□□□□ 0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM89A2RUT3 159 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 A8MXK9 166 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 RAC2P15153 192 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 NCK1P16333 377 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KA3P51812 740 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD6P3P58550 94 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 ACTG1P63261 375 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 LCN2P80188 198 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 TUSC1Q2TAM9 212 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FGD3Q5JSP0 725 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 OR2Z1Q8NG97 314 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 OR1F12Q8NHA8 337 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 CMBLQ96DG6 245 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 CMTM5Q96DZ9 223 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FUZQ9BT04 418 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 MED4Q9NPJ6 270 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF16Q9NXF7 216 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 DYSFO75923 2080 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 IFNL4K9M1U5 179 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 ADRA2CP18825 462 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PSME3P61289 254 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 BTG1P62324 171 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H3AP68431 136 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW12Q6X9E4 464 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PTCHD4Q6ZW05 846 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H3AQ71DI3 136 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFB2Q8N4F0 458 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 NUAK2Q9H093 628 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 MYLK2Q9H1R3 596 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SOCS2O14508 198 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 CPT2P23786 658 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 CRABP1P29762 137 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PRDX6P30041 224 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SEC23BQ15437 767 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 GLYATQ6IB77 296 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SLC27A4Q6P1M0 643 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 DNM1P34Q6PK57 102 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCD3Q6STE5 483 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB108BQ8NET1 73 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 OR5L1Q8NGL2 311 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A6Q92536 515 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 OR2V2Q96R30 315 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 COQ7Q99807 217 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A7Q99884 636 aa17.68■□□□□ 0.42
LIMS1-208ENST00000428064 GORASP2Q9H8Y8 452 aa17.68■□□□□ 0.42
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