RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SSX1Q16384 188 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 BAK1Q16611 211 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GTDC1Q4AE62 458 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CTRB2Q6GPI1 263 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PTOV1Q86YD1 416 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TAGAPQ8N103 731 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 OR8H2Q8N162 312 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 C10orf111Q8N326 155 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 STX19Q8N4C7 294 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CLDN22Q8N7P3 220 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF615Q8N8J6 731 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 OR5H6Q8NGV6 325 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ST8SIA4Q92187 359 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CMTM7Q96FZ5 175 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 RITA1Q96K30 269 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 Q96MT0 163 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 MGLLQ99685 303 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SOSTQ9BQB4 213 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 MED18Q9BUE0 208 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CALHM2Q9HA72 323 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF69Q9UC07 566 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 AASSQ9UDR5 926 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CMAHPQ9Y471 501 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 U3KQV3 271 aa4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A096LNT2 108 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A0B4J293 547 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1W2PQ09 198 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM89A2RUT3 159 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC182A6NF36 153 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 C17orf51A8MQB3 221 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LEUTXA8MZ59 168 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TP53I11O14683 189 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 RRHO14718 337 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ADAMDEC1O15204 470 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LMX1BO60663 402 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 TNFSF13O75888 250 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 RCBTB2O95199 551 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CSF3P09919 207 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC35E2P0CK97 266 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 BCKDHAP12694 445 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 S1PR1P21453 382 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ABCD3P28288 659 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CCKARP32238 428 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PCGF2P35227 344 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ACVR1BP36896 505 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 STARP49675 285 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 HMGA2P52926 109 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 CLDN20P56880 219 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 BTG1P62324 171 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 VAMP2P63027 116 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNJ10P78508 379 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM27E3Q08E93 113 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 FUT7Q11130 342 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 ST3GAL4Q11206 333 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 PTGR1Q14914 329 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 QPRTQ15274 297 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM120AOSQ5T036 256 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.86□□□□□ -1.63
NANOGP4-201ENST00000427230 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms