RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426585.5

TPTEP1-204, Transcript of TPTE pseudogene 1, human

TSL 1 (best)

Gene TPTEP1, Length 5,725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPTEP1-204	ENST00000426585	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TNFSF4	P23510	183 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	GPR85	P60893	370 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	CASP6	P55212	293 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TSLP	Q969D9	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TAAR5	O14804	337 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TBP	P20226	339 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	ALOX5AP	P20292	161 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	VAMP5	O95183	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	CD3D	P04234	171 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR4E1	P0C645	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	CLINT1	Q14677	625 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	MYOT	Q9UBF9	498 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	XRCC3	O43542	346 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	DCTD	P32321	178 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	HTD2	P86397	168 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	COTL1	Q14019	142 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585		A0A0B4J2E0	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585		A0A1B0GX12	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	CD160	O95971	181 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	QDPR	P09417	244 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	LAP3	P28838	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	EMP3	P54852	163 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	GPNMB	Q14956	572 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	DSCR3	O14972	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SERPINF1	P36955	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	EDA	Q92838	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585		A0A087WUJ7	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	LRP5L	A4QPB2	252 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	SHOX	O15266	292 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	IDS	B3KWA1	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585		H7C1Q1	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	PLPP2	O43688	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPTEP1-204	ENST00000426585	FOLR1	P15328	257 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms