RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DOCK7Q96N67 2140 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CENPOQ9BU64 300 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MRI1Q9BV20 369 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TMED9Q9BVK6 235 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLITRK2Q9H156 845 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PRORYQ9H606 182 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MALT1Q9UDY8 824 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 LRP12Q9Y561 859 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MEGF11A6BM72 1044 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR6C6A6NF89 314 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 K7EM74 188 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZFPL1O95159 310 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 GPANK1O95872 356 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CD2P06729 351 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF9P0C862 333 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 EDN3P14138 238 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NR4A1P22736 598 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CDAP32320 146 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TPTEP56180 551 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NCS1P62166 190 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 P2RY6Q15077 328 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 RAB35Q15286 201 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 GUSBP1Q15486 140 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF404Q494X3 552 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C22orf42Q6IC83 251 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 DRAM2Q6UX65 266 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 BEND4Q6ZU67 534 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SSX8Q7RTT4 187 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MAP6Q96JE9 813 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf45Q96LM5 186 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ATF6BQ99941 703 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SH3GL3Q99963 347 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 EMC7Q9NPA0 242 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 HHLA2Q9UM44 414 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SVILO95425 2214 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CASKO14936 926 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SGCEO43556 437 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UBL3O95164 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CDRT1O95170 752 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 IL18BPO95998 194 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 TPOP07202 933 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 UCHL1P09936 223 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 ABOP16442 354 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 SRMP19623 302 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PCSK6P29122 969 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 S100A5P33763 92 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-211ENST00000425989 PSMB10P40306 273 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms