RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPI1P17947 270 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNR1P21554 472 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAX6P26367 422 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRSS3P35030 304 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 P2RY2P41231 377 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCR2P41597 374 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 CBX5P45973 191 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 STARP49675 285 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 H2BFSP57053 126 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 FHL1Q13642 323 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM189A2Q15884 450 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 FCRLAQ7L513 359 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSX6Q7RTT6 188 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 GFI1Q99684 422 aa3.16□□□□□ -1.9
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RNU6-55P-201ENST00000411092 HPF1Q9NWY4 346 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF186Q9NXI6 227 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 COMMD9Q9P000 198 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 CKLFQ9UBR5 152 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 DAPP1Q9UN19 280 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.15□□□□□ -1.91
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