RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 TOPBP1Q92547 1522 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM210A6NLX4 147 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 SULT1C4O75897 302 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 SPCS3P61009 180 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 NCALDP61601 193 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 SGCAQ16586 387 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 RESP18Q5W5W9 173 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 TPD52L3Q96J77 140 aa2.13□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 SIPA1L1O43166 1804 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 NID2Q14112 1375 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 VWDEQ8N2E2 1590 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0G2JLM5 398 aa2.12□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC182A6NF36 153 aa2.12□□□□□ -2.07
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