RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 PNLIPP16233 465 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ISL1P61371 349 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 REEP6Q96HR9 211 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GLTPQ9NZD2 209 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 B9D1Q9UPM9 204 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 OR5H15A6NDH6 313 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 IMPA2O14732 288 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ARPC5O15511 151 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SULT1C4O75897 302 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 FCARP24071 287 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GDNFP39905 211 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ETV1P50549 477 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ST7LQ8TDW4 575 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 A0A0B4J2E0 115 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GX12 115 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 TMEM82A0PJX8 343 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 B8ZZF3 427 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 HS3ST1O14792 307 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GLRA1P23415 457 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 S100A7P31151 101 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 KIR2DS4P43632 304 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 DLX5P56178 289 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 KIR2DS1Q14954 304 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 R4GMQ9 66 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 BHLHE40O14503 412 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SH2D1BO14796 132 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 TGM4P49221 684 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 RELAQ04206 551 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 MLXQ9UH92 298 aa9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 IFNA4P05014 189 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 BMP5P22003 454 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 UCNP55089 124 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 WNT3P56703 355 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SRPXP78539 464 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 FZD5Q13467 585 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ISXQ2M1V0 245 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 MBOAT4Q96T53 435 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GV50 99 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SSX5O60225 188 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 BATF2Q8N1L9 274 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 OR4A16Q8NH70 328 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 HES7Q9BYE0 225 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 BANF2Q9H503 90 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 MMP25Q9NPA2 562 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 TSPAN4O14817 238 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 RAC1P63000 192 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SLC17A1Q14916 467 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 MDGA2Q7Z553 956 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 C3orf49Q96BT1 292 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 TUBG1P23258 451 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 AQP6Q13520 282 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GSG1Q2KHT4 349 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 DESI1Q6ICB0 168 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 LAX1Q8IWV1 398 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 RGCCQ9H4X1 137 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms