RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384040.1

RNU6-949P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 949, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-949P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GFERP55789 205 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MXD1Q05195 221 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GAMTQ14353 236 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CLINT1Q14677 625 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CHRNA6Q15825 494 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DGUOKQ16854 277 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SFT2D3Q587I9 215 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PDZD11Q5EBL8 140 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PYHIN1Q6K0P9 492 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCDC80Q76M96 950 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 NKAIN4Q8IVV8 208 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SPC24Q8NBT2 197 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR4C13Q8NGP0 309 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR10R2Q8NGX6 335 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SEH1LQ96EE3 360 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C14orf79Q96F83 325 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FICDQ9BVA6 458 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RACGAP1Q9H0H5 632 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR51B4Q9Y5P0 310 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SSH2Q76I76 1423 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCL21O00585 134 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CLDN3O15551 220 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DPM1O60762 260 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RDH16O75452 317 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR7A10O76100 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IGHG2P01859 326 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KRT14P02533 472 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RPN2P04844 631 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CRYGBP07316 175 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CTSLP07711 333 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CTRB1P17538 263 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RAB3AP20336 220 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CYP2F1P24903 491 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DNAJB1P25685 340 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LAP3P28838 519 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 P2RX1P51575 399 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RPL23P62829 140 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CYP24A1Q07973 514 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SIGLEC14Q08ET2 396 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DPYSL2Q16555 572 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KCTD21Q4G0X4 260 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FILIP1LQ4L180 1135 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GPR119Q8TDV5 335 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LRRC29Q8WV35 223 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF606Q8WXB4 792 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OSTF1Q92882 214 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CNDP1Q96KN2 507 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ATP6V0BQ99437 205 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TTTY12Q9BZ98 90 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LRRN3Q9H3W5 708 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 THAP9Q9H5L6 903 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RAB18Q9NP72 206 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SUN2Q9UH99 717 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IL19Q9UHD0 177 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PALLDQ8WX93 1383 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 COL4A2P08572 1712 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LCTP09848 1927 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-949P-201ENST00000384040 AK9Q5TCS8 1911 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-949P-201ENST00000384040 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-949P-201ENST00000384040 A0A1B0GUH1 482 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms