RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL41O60662 606 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDUFB10O96000 172 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHDP01880 384 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 HLA-DQB1P01920 261 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRYGBP07316 175 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTSLP07711 333 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACSM4P0C7M7 580 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB3AP20336 220 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOXP28300 417 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCAR3P49019 387 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 P2RX1P51575 399 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDKN2DP55273 166 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRMT2P55345 433 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1CBP62140 327 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRADDP78560 199 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAJINQ3KP22 176 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPV17L2Q567V2 206 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 AP1ARQ63HQ0 302 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM107Q6UX40 140 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX20Q7Z614 316 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPWQ8N729 165 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC52Q8N7C0 313 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13G1Q8NGZ3 307 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC29Q8WV35 223 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO32Q969P5 355 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEKT3Q9BXF9 490 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51M1Q9H341 326 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 METTL7AQ9H8H3 244 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 EDA2RQ9HAV5 297 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM9BQ9NQ34 198 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf17Q9NRJ1 99 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC2A8Q9NY64 477 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKNAQ7Z591 1439 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 VGLL3A8MV65 326 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHST1O43916 411 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 RDH16O75452 317 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PALMO75781 387 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV3-25P01717 112 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANXA5P08758 320 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF688P0C7X2 276 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL1RNP18510 177 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATF6P18850 670 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNNI1P19237 187 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 GGT1P19440 569 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL8A2P25067 703 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXN2P32314 431 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAS2R31P59538 309 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK5Q00535 292 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 QPRTQ15274 297 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPM1LQ5SGD2 360 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR107Q5VW38 600 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CERS6Q6ZMG9 384 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM150AQ86TG1 271 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 COX18Q8N8Q8 333 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM105Q8N8V8 129 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NECAB1Q8N987 351 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR9A2Q8NGT5 310 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHC3Q92529 594 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 MICU1Q9BPX6 476 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBL1YQ9BQ87 522 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf198Q9H425 327 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 PALLDQ8WX93 1383 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP47Q96K76 1375 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMKR1H3BMG3 65 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 H7C417 338 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NVLO15381 856 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHST10O43529 356 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 FKBP6O75344 327 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC22A5O76082 557 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 H6PDO95479 791 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERGP11308 486 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ME2P23368 584 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD34P28906 385 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACLYP53396 1101 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 GFERP55789 205 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNJ2BPP57105 145 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACTR3P61158 418 aa1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms