RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM65Q6PI78 240 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF546Q86UE3 836 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 APH1BQ8WW43 257 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 ST8SIA4Q92187 359 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 SLC7A6Q92536 515 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM230Q96A57 120 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-202ENST00000356435 OR1C1Q15619 314 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-202ENST00000356435 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-202ENST00000356435 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-202ENST00000356435 GPR3P46089 330 aa5.05□□□□□ -1.6
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