RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PFN4Q8NHR9 129 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PKP2Q99959 881 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NUAK2Q9H093 628 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GPR35Q9HC97 309 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM25GB3EWG6 89 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 ATF6BQ99941 703 aa3.91□□□□□ -1.78
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