RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MBOAT4Q96T53 435 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TFAP2AP05549 437 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 BAGE3Q86Y29 109 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 BAGE2Q86Y30 109 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 RNF141Q8WVD5 230 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 GON7Q9BXV9 100 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1456Q9P272 454 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPC4 97 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TSTD3H0UI37 97 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 THEM4Q5T1C6 240 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 FCRL6Q6DN72 434 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 HES7Q9BYE0 225 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 C20orf24Q9BUV8 137 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 M0R135 149 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF195O14628 629 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 GAB3Q8WWW8 586 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 K7EQM0 130 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 GPR119Q8TDV5 335 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 GLB1P16278 677 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 EXD3Q8N9H8 876 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 LRP5LA4QPB2 252 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 LAP3P28838 519 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 HRO43593 1189 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 HOXD12P35452 270 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 NRASP01111 189 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A12P48065 614 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZS52 159 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 OR5H6Q8NGV6 325 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TAF9BQ9HBM6 251 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 HMX2A2RU54 273 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZRG5 221 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35B4Q969S0 331 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TBPP20226 339 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF620Q6ZNG0 422 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 OXGR1Q96P68 337 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 CRYAAP02489 173 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SOHLH1Q5JUK2 328 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 TMUB2Q71RG4 321 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 OR52N5Q8NH56 324 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 YIPF5Q969M3 257 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SARGQ9BW04 601 aa20.34■□□□□ 0.85
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