RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 DUX4Q9UBX2 424 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WUU8 490 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 A0A0G2JK05 382 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 LRRN3E7EW58 273 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 EFSO43281 561 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 CRYBA1P05813 215 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CCL3P10147 92 aa9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 RAD52P43351 418 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PITPNAQ00169 270 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MFAP5Q13361 173 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 HES5Q5TA89 166 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 TMEM239Q8WW34 195 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 C3orf49Q96BT1 292 aa9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 ADAM19Q9H013 955 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OR10A4Q9H209 315 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 LRFN1Q9P244 771 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MIOXQ9UGB7 285 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.13□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WUJ7 227 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OR6C68A6NDL8 312 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 DISC1C4P0D8 188 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PTGFRP43088 359 aa9.12□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 AVPI1Q5T686 147 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CDK20Q8IZL9 346 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SVBPQ8N300 66 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 FADS6Q8N9I5 356 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ELOA3Q8NG57 546 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.12□□□□□ -0.95
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GINS3-201ENST00000318129 RASL12Q9NYN1 266 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MED31Q9Y3C7 131 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MED13Q9UHV7 2174 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WZY1 265 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 C2orf72A6NCS6 295 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 RNF13O43567 381 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SPDEFO95238 335 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SPI1P17947 270 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CNR1P21554 472 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MPGP29372 298 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 GDNFP39905 211 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CCL11P51671 97 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CCR9P51686 369 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MOB3CQ70IA8 216 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 PGAP1Q75T13 922 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 GRINAQ7Z429 371 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 MEIOBQ8N635 442 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OR2M3Q8NG83 312 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ZNF69Q9UC07 566 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 OPN4Q9UHM6 478 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.11□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 CTDSPLO15194 276 aa9.11□□□□□ -0.95
GINS3-201ENST00000318129 SC5DO75845 299 aa9.11□□□□□ -0.95
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