RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 CPT2P23786 658 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 PSMB6P28072 239 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 SRYQ05066 204 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 CMTM3Q96MX0 182 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 TMEM225BP0DP42 221 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 GLB1P16278 677 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 BCKDHBP21953 392 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 C19orf48Q6RUI8 117 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 SULF2Q8IWU5 870 aa15.5■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.5■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.49■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.49■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.49■□□□□ 0.07
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TRPC1-201ENST00000273482 IL33O95760 270 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 HLA-DQB1P01920 261 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 CPN1P15169 458 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 CTRB1P17538 263 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 HLA-BQ31612 363 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.48■□□□□ 0.07
TRPC1-201ENST00000273482 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.48■□□□□ 0.07
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