RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 HMSDA8MTL9 139 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 DISC1C4P0D8 188 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ATF1P18846 271 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 PGCP20142 388 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 PAICSP22234 425 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CBLN2Q8IUK8 224 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ACBD7Q8N6N7 88 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 GPR119Q8TDV5 335 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM239Q8WW34 195 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SGCZQ96LD1 299 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TIMP4Q99727 224 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 UBQLN3Q9H347 655 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 J3QRE1 110 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CYB561P49447 251 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 FAAP20Q6NZ36 180 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SFT2D1Q8WV19 159 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SDHAF3Q9NRP4 125 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TINAGQ9UJW2 476 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 E9PI62 339 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 GNB5O14775 395 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 PFN4Q8NHR9 129 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD4Q8TB40 342 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 NTNG2Q96CW9 530 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 HCAR1Q9BXC0 346 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPTL4Q9BY76 406 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A32Q9H2D1 315 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM36Q9NQ86 728 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 G3V3Y1 287 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SULT1B1O43704 296 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 WISP1O95388 367 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINA3P01011 423 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SOX8P57073 446 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 BDH1Q02338 343 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF626Q68DY1 528 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00696Q6ZRV3 163 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ZFP82Q8N141 532 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR10H4Q8NGA5 316 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OPN4Q9UHM6 478 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ACVR1BP36896 505 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 WDSUB1Q8N9V3 476 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 THEM6Q8WUY1 208 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 C20orf141Q9NUB4 165 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WUJ7 227 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 DAPL1A0PJW8 107 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 AQP8O94778 261 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ECDO95905 644 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SPP1P10451 314 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TACR3P29371 465 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 CD96P40200 585 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 RFC3P40938 356 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF671Q8TAW3 534 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 DPH1Q9BZG8 443 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 BCL2L14Q9BZR8 327 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM19Q9H013 955 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ABI3Q9P2A4 366 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 FRYQ5TBA9 3013 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LOC400499M0QZD8 3231 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF35P13682 527 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00303Q3SY05 128 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 NIPAL3Q6P499 406 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR2M3Q8NG83 312 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 OR52I2Q8NH67 350 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 JAM3Q9BX67 310 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R10Q9NYW0 307 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-201ENST00000265339 LRFN1Q9P244 771 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms