RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM68Q96MH6 324 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC61Q9BV99 259 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 BCO1Q9HAY6 547 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 CD3DP04234 171 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 GPNMBQ14956 572 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A25Q6T423 547 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 LGI3Q8N145 548 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 KLK11Q9UBX7 282 aa15.98■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 METTL12A8MUP2 240 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 HSPB6O14558 160 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PLPP2O43688 288 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ICMTO60725 284 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OTPQ5XKR4 325 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 GPR84Q9NQS5 396 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TOR1AO14656 332 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OR10K2Q6IF99 312 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PELI1Q96FA3 418 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 CNR1P21554 472 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 CATR1Q13166 79 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 MARC2Q969Z3 335 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 MMP25Q9NPA2 562 aa15.97■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 RNF212BA8MTL3 300 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 D6RAR5 112 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ATF1P18846 271 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ALOX5APP20292 161 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZIC1Q15915 447 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF425Q6IV72 752 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 COMTD1Q86VU5 262 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 UCN3Q969E3 161 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 C3orf49Q96BT1 292 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 FOXQ1Q9C009 403 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OR2F2O95006 317 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OR2F1Q13607 317 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TTC9Q92623 222 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 SPACA5Q96QH8 159 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 AKR7A2O43488 359 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 IFNA10P01566 189 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 CD79BP40259 229 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 RBP2P50120 134 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PCK2Q16822 640 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.96■□□□□ 0.15
SCARB2-201ENST00000264896 RNF4P78317 190 aa15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 MED30Q96HR3 178 aa15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM100Q9NV29 134 aa15.96■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 XRCC3O43542 346 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 GUSBP08236 651 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 PRKACAP17612 351 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 TDHQ8IZJ6 230 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 SEH1LQ96EE3 360 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 OXGR1Q96P68 337 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 M0R135 149 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 M6PRP20645 277 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 Q6ZS52 159 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF799Q96GE5 643 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 OR8B4Q96RC9 309 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 NUDT9Q9BW91 350 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 SLC17A2O00624 439 aa15.95■□□□□ 0.14
SCARB2-201ENST00000264896 TNFSF4P23510 183 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms