RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MCUBQ9NWR8 336 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 V9GY05 133 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf66A4D0T2 115 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM212A6NML5 194 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT7O00154 380 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TO15178 435 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SCO2O43819 266 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6A2O95222 327 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 WDPCPO95876 746 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TFP02787 698 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBP04435 133 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CD63P08962 238 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CLUP10909 449 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ABOP16442 354 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCAP17252 672 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MAOAP21397 527 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRA4P48169 554 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC37A1P57057 533 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG2P59768 71 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RAC1P63000 192 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BTG2P78543 158 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EGR3Q06889 387 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SKP2Q13309 424 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MADCAM1Q13477 382 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FHL1Q13642 323 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CBFBQ13951 182 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 INSL4Q14641 139 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 COX15Q7KZN9 410 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LINGO2Q7L985 606 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6V1Q8N148 313 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6S1Q8NH40 331 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 STK35Q8TDR2 534 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMF1Q92530 271 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NINJ1Q92982 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF5Q969M3 257 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF21AQ96BD5 680 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UPRTQ96BW1 309 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RASD2Q96D21 266 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RADILQ96JH8 1075 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF170Q96K19 258 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C18orf12Q96KH6 178 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR137Q96N19 417 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NMNAT3Q96T66 252 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51J1Q9H342 316 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP25Q9NPA2 562 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NOX4Q9NPH5 578 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC13O75165 2243 aa6.27□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C68A6NDL8 312 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NIZ1 184 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 IFITM5A6NNB3 132 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM10O14672 748 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HCRTR2O43614 444 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB5O43674 189 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SSNA1O43805 119 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T1O43869 369 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENOFO60613 162 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ALX3O95076 343 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 AHSA1O95433 338 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT14O95848 222 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PAHP00439 452 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HPP00738 406 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CD2P06729 351 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HEXAP06865 529 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF1P18846 271 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms