RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 C5orf34Q96MH7 638 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 RAB33BQ9H082 229 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 SPEF1Q9Y4P9 236 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 WIPF3A6NGB9 483 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 PMPCAQ10713 525 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 KLK13Q9UKR3 277 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB40C-201ENST00000248139 CRABP1P29762 137 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SCAND1P57086 179 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TLE3Q04726 772 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GVQW1Q8N7I0 195 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ASB10Q8WXI3 467 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 WBP1Q96G27 269 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SPACA5Q96QH8 159 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 HSPB2A8KAH6 182 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GNALP38405 381 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 FOXF1Q12946 379 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 HSPB2Q16082 182 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GLRX5Q86SX6 157 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR1J2Q8NGS2 313 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LGALS8O00214 317 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR4E1P0C645 316 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SRFP11831 508 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LIN54Q6MZP7 749 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM82A0PJX8 343 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CCSO14618 274 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR2T1O43869 369 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LINC00052Q96N35 136 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 EFNA2O43921 213 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SPDEFO95238 335 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LPLP06858 475 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ANOS1P23352 680 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR52W1Q6IF63 320 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SLC6A7Q99884 636 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SOX7Q9BT81 388 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 H2BFMP0C1H6 154 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 BIDP55957 195 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR52N4Q8NGI2 321 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ITGB2P05107 769 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 NMBP08949 121 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 PPP3CBP16298 524 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TAS2R19P59542 299 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 HSF1Q00613 529 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CHST4Q8NCG5 386 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR6M1Q8NGM8 313 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SDHAF2Q9NX18 166 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 KCNN3Q9UGI6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SLC2A1P11166 492 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 BPIFB2Q8N4F0 458 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 SEC22AQ96IW7 307 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 KCNK17Q96T54 332 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 RP2O75695 350 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CYB5AP00167 134 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 IGHMP01871 453 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ACTBP60709 375 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ACTG1P63261 375 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TDGQ13569 410 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LY6G6FQ5SQ64 297 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 MICU1Q9BPX6 476 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 REG4Q9BYZ8 158 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GIMD1P0DJR0 217 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CFPP27918 469 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CDAP32320 146 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 PTGS2P35354 604 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 MFAP5Q13361 173 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF735P0CB33 412 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GABRA1P14867 456 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 PXDC1Q5TGL8 231 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 CARD17Q5XLA6 110 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM234Q8WY98 164 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 MARVELD3Q96A59 401 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 COL6A3P12111 3177 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 BEX5Q5H9J7 111 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF454Q8N9F8 522 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB40C-201ENST00000248139 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms