RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CTRCQ99895 268 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GPR173Q9NS66 373 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SYT17Q9BSW7 474 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM77I1YAP6 450 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DBHP09172 617 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GPM6AP51674 278 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FOXA1P55317 472 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PRDX4Q13162 271 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RPEL1Q2QD12 228 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NRAPQ86VF7 1730 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GUH1 482 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR4E1P0C645 316 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA5P54756 1037 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TTC32Q5I0X7 151 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 EXTL1Q92935 676 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PEX11GQ96HA9 241 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MED9Q9NWA0 146 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GV72 72 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 M0R1X1 148 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 XRCC3O43542 346 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MTCP1P56278 107 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CREBZFQ9NS37 354 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IGLON5A6NGN9 336 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PAPLNO95428 1278 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO45P0C2W1 286 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MRAP2Q96G30 205 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PKIBQ9C010 78 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CBR1P16152 277 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PPOXP50336 477 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GPR85P60893 370 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RELBQ01201 579 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SRYQ05066 204 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZTK2 550 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RNF39Q9H2S5 420 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A6NIN4 97 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SYT5O00445 386 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TM4SF1P30408 202 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HHEXQ03014 270 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DOC2BQ14184 412 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NOX4Q9NPH5 578 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PN81 502 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HPP00738 406 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNA7P36544 502 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN20P56880 219 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM189BP81408 668 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NAXDQ8IW45 347 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms