RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC75AQ8NAA5 344 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD8Q96LT4 415 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 THRBP10828 461 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTM3P21266 225 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MSR1P21757 451 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT4P22083 530 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CTXN1P60606 82 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC8Q8TC99 324 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ITLN1Q8WWA0 313 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI30P13284 250 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF1AP19438 455 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF4P23510 183 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL9Q6T311 187 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TREML4Q6UXN2 200 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MICU2Q8IYU8 434 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 NPEPL1Q8NDH3 523 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFA2Q96DR5 249 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC7Q9NPA0 242 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 POLE4Q9NR33 117 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C1C5 153 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 KITLGP21583 273 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ERFP50548 548 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN6P62502 163 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FHL1Q13642 323 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A3R2Q15599 337 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT9Q86SS6 491 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CMBLQ96DG6 245 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MED4Q9NPJ6 270 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5V1Q9UGF6 321 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 FXYD1O00168 92 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 COX5BP10606 129 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR5AP47898 357 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IL13RA1P78552 427 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFA6Q01524 100 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PAX8Q06710 450 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ESCO2Q56NI9 601 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TTMPQ5BVD1 217 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 JAZF1Q86VZ6 243 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51A7Q8NH64 312 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A28Q96A46 364 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 IL19Q9UHD0 177 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 A4GNTQ9UNA3 340 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NIZ1 184 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM18A8MTB9 384 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN34H7C241 214 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK2O60496 412 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CD80P33681 288 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MDH2P40926 338 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP16P51512 607 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP1BP61224 184 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP1AP62834 184 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90B2PQ58FF3 399 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRC1Q96M27 445 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2V2Q96R30 315 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 ECSITQ9BQ95 431 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD10Q9Y365 291 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM178BH3BS89 294 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PAX2Q02962 417 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ST3GAL3Q11203 375 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CYBRD1Q53TN4 286 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 LEG1Q6P5S2 330 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP8Q8N3A8 854 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 HAVCR1Q96D42 359 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 POM121CA8CG34 1229 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA14P01570 189 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT2P09544 360 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBG1P23258 451 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRN3Q0VDG4 424 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 NRMQ8IXM6 262 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C2Q8NGS9 318 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A6Q92536 515 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TPD52L3Q96J77 140 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF583Q96ND8 569 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3GL1Q99961 368 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 GCM1Q9NP62 436 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBG2Q9NRH3 451 aa21.5■■□□□ 1.03
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