RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ARL6IP5O75915 188 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 IGLV3-19P01714 112 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 HPXP02790 462 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 AKR1C2P52895 323 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 AKR1C1Q04828 323 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 POU4F2Q12837 409 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM106AQ96A25 262 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A38Q96DW6 304 aa13.57□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 CXCL2P19875 107 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.245e-22■■■■■ 43.9
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CTIF-205ENST00000587860 ACKR1Q16570 336 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 LINC00346Q8IVM7 164 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SYNPRQ8TBG9 265 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM131Q92545 1883 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 EMC6Q9BV81 110 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 IFITM5A6NNB3 132 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 C10orf142B7Z368 130 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ARPC3O15145 178 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 UPK3AO75631 287 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A12O75746 678 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 IGKV3-11P04433 115 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 DCTDP32321 178 aa13.56□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 RFC3P40938 356 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 TPRA1Q86W33 373 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 OR5V1Q9UGF6 321 aa13.55□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 BTG1P62324 171 aa13.54□□□□□ -0.24
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CTIF-205ENST00000587860 SYS1Q8N2H4 156 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.54□□□□□ -0.24
CTIF-205ENST00000587860 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa13.54□□□□□ -0.24
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