RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM15Q7Z3B0 74 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CLRN3Q8NCR9 226 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF680Q8NEM1 530 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 AKR7A2O43488 359 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR2F2O95006 317 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 G0S2P27469 103 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 HSF1Q00613 529 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP8Q13202 625 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR2F1Q13607 317 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D28Q2M2D7 210 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 J3QR89 54 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DEGS1O15121 323 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ADPRHP54922 357 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GPR85P60893 370 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SFT2D1Q8WV19 159 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 LGALS8O00214 317 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 HS3ST1O14792 307 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CSF3P09919 207 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 NME1P15531 152 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SDHAP31040 664 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CD80P33681 288 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DOC2BQ14184 412 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 IKZF5Q9H5V7 419 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GRPP07492 148 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 IRS1P35568 1242 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR8G2PQ6IF36 304 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SSX7Q7RTT5 188 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR13C5Q8NGS8 318 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SCPEP1Q9HB40 452 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CHST11Q9NPF2 352 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP13Q9UII6 198 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TARM1B6A8C7 271 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DCTN6O00399 190 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SPINT2O43291 252 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TAF9Q16594 264 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPERDQ86XM0 798 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GCNT2Q8N0V5 402 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF561Q8N587 486 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 YIPF6Q96EC8 236 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 BCO1Q9HAY6 547 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OBP2AQ9NY56 170 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 LAMA4Q16363 1823 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 FGF17O60258 216 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 KCNAB1Q14722 419 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35G3Q8N808 338 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 WBP2Q969T9 261 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SIGIRRQ6IA17 410 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR51A2Q8NGJ7 313 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR10J5Q8NHC4 309 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 NGBQ9NPG2 151 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 NME2P1O60361 137 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR10A3P58181 314 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM88Q6PEY1 159 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GABRG1Q8N1C3 465 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GAREM1Q9H706 876 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DECR2Q9NUI1 292 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA9Q9UGM1 479 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y8X5 98 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 FABP5Q01469 135 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EXT1Q16394 746 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 BHLHE23Q8NDY6 225 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR8U1Q8NH10 309 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EDAQ92838 391 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OPALINQ96PE5 141 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ALOX5APP20292 161 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP1P28562 367 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ELLP55199 621 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SLAMF6Q96DU3 332 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GUL6 1792 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF724A8MTY0 619 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 RRADP55042 308 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DPTQ07507 201 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EDDM3AQ14507 147 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EMC4Q5J8M3 183 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM81Q6P7N7 255 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPTL6Q8NI99 470 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 LYSMD1Q96S90 227 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA4CQ9C0C4 833 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 GPR171O14626 319 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF10CO14798 259 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms