RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574770.5

EDC4-208, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 5

Gene EDC4, Length 1,425 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	OR52N5	Q8NH56	324 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MUL1	Q969V5	352 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TBX5	Q99593	518 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	APOC1	P02654	83 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	COX5A	P20674	150 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	EDNRA	P25101	427 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ARR3	P36575	388 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MAP2K4	P45985	399 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ALDH3B2	P48448	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MED22	Q15528	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	NEDD8	Q15843	81 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MEP1B	Q16820	701 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	XAF1	Q6GPH4	301 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SSX8	Q7RTT4	187 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	KRT77	Q7Z794	578 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	RPRML	Q8N4K4	120 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	NAXE	Q8NCW5	288 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ST7L	Q8TDW4	575 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ASB5	Q8WWX0	329 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	OR8B4	Q96RC9	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ABHD6	Q9BV23	337 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770		Q9UFV3	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ESPL1	Q14674	2120 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770		B8ZZF3	427 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	CCL21	O00585	134 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	UBL3	O95164	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	PTH	P01270	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ITGA5	P08648	1049 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	B4GALT1	P15291	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	HOXC12	P31275	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GPR50	Q13585	617 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TIGD6	Q17RP2	521 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	MGLL	Q99685	303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770		A8MXE2	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF878	C9JN71	531 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SCG5	P05408	212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	CD53	P19397	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	IGHV1-2	P23083	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TGM4	P49221	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	HCCS	P53701	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	RAB35	Q15286	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	GPR141	Q7Z602	305 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SKA3	Q8IX90	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	LRRC46	Q96FV0	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	C4orf36	Q96KX1	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDC4-208	ENST00000574770	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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