RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SHISA9	B4DS77	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SGCE	O43556	437 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ENTPD6	O75354	484 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CTAG2	O75638	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV3-15	P01624	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV1-44	P01699	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	PTAFR	P25105	342 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SSTR2	P30874	369 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ENTPD1	P49961	510 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NUDT6	P53370	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	EFNB1	P98172	346 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	IL5RA	Q01344	420 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NAAA	Q02083	359 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	PLP2	Q04941	152 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	AQP6	Q13520	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	RIPK1	Q13546	671 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NRN1L	Q496H8	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	KRT80	Q6KB66	452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CDC20B	Q86Y33	519 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	INTS14	Q96SY0	518 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	AMELY	Q99218	206 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TBX5	Q99593	518 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ADI1	Q9BV57	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	VCX	Q9H320	206 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CDH20	Q9HBT6	801 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	C5orf49	A4QMS7	147 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SLC16A6	O15403	523 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	PRODH	O43272	600 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CRYAA	P02489	173 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SERPINA5	P05154	406 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	DBH	P09172	617 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	GNAO1	P09471	354 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	STOM	P27105	288 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	APLNR	P35414	380 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CAPG	P40121	348 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NR1H2	P55055	460 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	PCBD1	P61457	104 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	HGFAC	Q04756	655 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	KEAP1	Q14145	624 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	RAB35	Q15286	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF691	Q5VV52	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TIGD4	Q8IY51	512 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	C14orf79	Q96F83	325 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	TEAD3	Q99594	435 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	LIME1	Q9H400	295 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	C8orf4	Q9NR00	106 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CENPM	Q9NSP4	180 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	FZR1	Q9UM11	496 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPL4-208	ENST00000564744	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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