RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561840.1

TRAPPC2L-202, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ZMAT1Q5H9K5 638 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 C16orf89Q6UX73 402 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 USP51Q70EK9 711 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 GLB1L2Q8IW92 636 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ZNF101Q8IZC7 436 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ELMOD3Q96FG2 381 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 C1orf159Q96HA4 380 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 C7orf34Q96L11 122 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 NSMCE2Q96MF7 247 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 COG8Q96MW5 612 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 LRRC37BQ96QE4 947 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 DIRC2Q96SL1 478 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 NRIP3Q9NQ35 241 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 PLEK2Q9NYT0 353 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 IL20RAQ9UHF4 553 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TAGLN3Q9UI15 199 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 V9GYQ6 96 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 STAB1Q9NY15 2570 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CLDN25C9JDP6 229 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 H3BSA7 217 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 DOK2O60496 412 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 DCTN3O75935 186 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 NGFP01138 241 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SCG5P05408 212 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 GAAP10253 952 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CTLA4P16410 223 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TNFSF4P23510 183 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CRABP1P29762 137 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MPV17P39210 176 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SLC3A1Q07837 685 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 AQP6Q13520 282 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MESTQ5EB52 335 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 FAM122BQ7Z309 247 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ADCK1Q86TW2 530 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 OR51F2Q8NH61 342 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CCL17Q92583 94 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TMEM186Q96B77 213 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RASD2Q96D21 266 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RAB39BQ96DA2 213 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SYT4Q9H2B2 425 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 METRNQ9UJH8 293 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 OR10H3O60404 316 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RP2O75695 350 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RENP00797 406 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 IGHV1-46P01743 117 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 FABP3P05413 133 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MSMBP08118 114 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 NOS3P29474 1203 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SLC6A6P31641 620 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 LIMS1P48059 325 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MMP15P51511 669 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 GYS2P54840 703 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 LMO4P61968 165 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SCGB2A2Q13296 93 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SEC23BQ15437 767 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RFX4Q33E94 735 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 MTX3Q5HYI7 312 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 AVPI1Q5T686 147 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 PTP4A1Q93096 173 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 CMBLQ96DG6 245 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC2L-202ENST00000561840 IFT27Q9BW83 186 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms