RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	MAPK11	Q15759	364 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MAPK14	Q16539	360 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DUSP7	Q16829	419 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	C10orf111	Q8N326	155 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CADM2	Q8N3J6	435 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC38A4	Q969I6	547 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	APH1A	Q96BI3	265 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RADIL	Q96JH8	1075 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SEPHS2	Q99611	448 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ARHGDIG	Q99819	225 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NUAK2	Q9H093	628 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	VCX	Q9H320	206 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	REEP1	Q9H902	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	C8orf4	Q9NR00	106 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ACER3	Q9NUN7	267 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM160	Q9NX00	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	UPB1	Q9UBR1	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RCE1	Q9Y256	329 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RTTN	Q86VV8	2226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF724	A8MTY0	619 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SHISA9	B4DS77	424 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		E7EQL1	145 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		J3KRW8	73 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PRY	O14603	147 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF208	O43345	1280 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CD5L	O43866	347 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2T1	O43869	369 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	GADD45G	O95257	159 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CD8A	P01732	235 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ATP6V1B2	P21281	511 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MS4A2	Q01362	244 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SPIB	Q01892	262 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR1Q1	Q15612	314 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SYT14P1	Q58G82	188 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MUC15	Q8N387	334 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2T29	Q8NH02	315 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZG16B	Q96DA0	208 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ARL5B	Q96KC2	179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CHID1	Q9BWS9	393 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TEX12	Q9BXU0	123 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	VCX3B	Q9H321	246 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	EMC3	Q9P0I2	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MED31	Q9Y3C7	131 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		V9GYQ6	96 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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