RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF627Q7L945 461 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 FNDC8Q8TC99 324 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 KRT84Q9NSB2 600 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 VWFP04275 2813 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 H7C1C5 153 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NDUFS8O00217 210 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 WNT9BO14905 357 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DHHO43323 396 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 MGRN1O60291 552 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ALPLP05186 524 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 POU1F1P28069 291 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NOS3P29474 1203 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 GIPRP48546 466 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 LCN6P62502 163 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ESRRGP62508 458 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CDK5Q00535 292 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 FMODQ06828 376 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RIPK1Q13546 671 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DAG1Q14118 895 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 VHLLQ6RSH7 139 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CBR4Q8N4T8 237 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RBP7Q96R05 134 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NELFAQ9H3P2 528 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 USE1Q9NZ43 259 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 FKBP7Q9Y680 259 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 EI24O14681 340 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC2A10O95528 541 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 GRK5P34947 590 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CRISP1P54107 249 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 HILS1P60008 231 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 GINS1Q14691 196 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ACSM5Q6NUN0 579 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR4K13Q8NH42 304 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NMNAT3Q96T66 252 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DDOQ99489 341 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 FOXB1Q99853 325 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF747Q9BV97 191 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SYT4Q9H2B2 425 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SEC14L2O76054 403 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 RENP00797 406 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CTLA4P16410 223 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 EPHA2P29317 976 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF84P51523 738 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ALDH3A2P51648 485 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TBRG1Q3YBR2 411 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 LEG1Q6P5S2 330 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NSMAFQ92636 917 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 EME1Q96AY2 570 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 DUX5Q96PT3 197 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC29A1Q99808 456 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CMC2Q9NRP2 79 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 A0A096LPE4 126 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 A0A0A6YYJ9 748 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PPZ6 126 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR6C68A6NDL8 312 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms